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學校創建于1934年11月21日，坐落在廣西壯族自治區首府南寧市。學校前身是廣西省立醫學院，1949年11月更名為廣西省醫學院，1953年4月經中央衛生部批準更名為廣西醫學院，1996年5月經教育部批準更名為廣西醫科大學。學校建校至今曾七遷校址，其中1940年因時局動蕩，校址遷至桂林，1954年7月由桂林遷回南寧市現址至今。

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學校是全國建校較早的22所醫學院校之一，是全國最早定點招收外國留學生、港澳臺學生和華僑學生的8所醫學院校之一，是教育部批準的有招收本科臨床醫學專業（英語授課）留學生資格的首批30所高校之一，是廣西醫學教育、醫學研究、臨床醫療和預防保健的中心。2020年5月成為自治區人民政府與國家衛生健康委員會共建的高校，2021年成為自治區黨委、政府重點支持建設國內同類一流大學的高校。

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學校現擁有南寧-校本部、南寧-武鳴校區、玉林校區和五象校區（在建）4個校區，共占地約3300畝。其中，南寧-校本部位于南寧市青秀區雙擁路22號，總用地面積571畝；南寧-武鳴校區位于南寧市武鳴區武華大道武鳴段336號，總用地面積1433畝；玉林校區位于玉林市玉東新區高新科技產業園區，規劃用地總面積938畝；五象校區位于南寧市五象新區鳳凰路23號，規劃用地總面積約352畝。

 

教學機構完善，實踐基地齊全。學校設有19個二級學院（基礎醫學院、公共衛生學院、護理學院、藥學院、國際教育學院、高等職業技術學院、人文社會科學學院、馬克思主義學院、外國語學院、全科醫學院、信息與管理學院、生命科學研究院、繼續教育學院、體育與健康學院、第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、腫瘤醫學院、口腔醫學院、武鳴臨床醫學院）。設研究生院（研究生工作部），承擔研究生的招生培養、教學管理、學位點及導師隊伍建設、思政教育及日常管理工作。